中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所系于2016年底，基于上海生命科學(xué)研究院人口健康方向所屬的健康科學(xué)研究所、營養(yǎng)科學(xué)研究所、中科院-馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所、中科院-二軍大轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究院、中科院上海生命科學(xué)信息中心、中科院上海實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心等“三所一院兩中心”整合組建而設(shè)立。2018年底經(jīng)中科院正式發(fā)文批準(zhǔn)，營養(yǎng)與健康所順利進(jìn)入“率先行動(dòng)計(jì)劃”特色研究所籌建序列。研究所立足上海、輻射長三角、服務(wù)全國，針對我國符合中國人群的營養(yǎng)健康標(biāo)準(zhǔn)缺失、慢病防控與健康促進(jìn)的控制技術(shù)方法匱乏、生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)資源流失分散等國家重大需求中的科技創(chuàng)新供給力問題，以任務(wù)牽引的生物信息技術(shù)（BIT）融合發(fā)展、健康保障關(guān)口前移為特色學(xué)科，以中國人群高發(fā)的腫瘤、代謝性疾病（包括糖尿病及肥胖）和心血管疾病等重大慢病為研究對象，按照慢病防控與健康促進(jìn)、精準(zhǔn)營養(yǎng)與食品安全、生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)與健康智庫三大研究方向進(jìn)行布局。