學校最早創辦于1927年，原名為大鵬鵬城小學。在上級部門和熱心港商的努力下，具有24個班規模的新校舍于2001年9月落成，并更名為大鵬第二小學。學校占地24626m²，建筑面積7800m²。現有教職工53人，教師45人，在編21人，聘用24人，學歷100%達標，大專以上40人，占93%，其中本科15人，占35%，教師平均年齡30歲。現有學生685人，共16個班，戶籍學生132人，占有19%，暫住學生553人，占81%。學校2002年5月通過區一級學校評估，2004年6月通過市一級學校評估，2005年12月通過省一級學校評估。

學校堅持鄧小平的“教育要面向現代化，面向世界，面向未來”的教育方針，和“面向全體，全面發展。一切為了孩子，為了一切孩子，為了孩子的一切”的辦學思想。堅持“以質量求生存，以特色求發展”的辦學理念，積極實現“常規規范、質量良好、特色明顯、有示范性”的辦學目標。

學校堅持制度加人性化的管理。制度健全，管理民主，建立了行政會議制度、教職工代表會制度、家長委員會制度;各部門職責分明、各司其責;大事由教職工代表會討論，校務公開;實行月度、期末考核;堅持開放辦學，每學期對學生進行普訪，每學年舉辦一次教學開放日，召開一次家長會。讓學生、家長評價學校、教師的工作。收費、招生、教學成績向社會、家長公開。

學校德育工作初步形成了“以愛國主義教育為主旋律，以養成教育為重點，以關愛、體驗教育為載體”的工作模式積極開展工作。利用大鵬所城、核電站等周邊教育資源開展我愛大鵬所城、革命故事會、“尋找先輩足跡”等愛國主義教育活動;組織各種關愛活動和體驗教育活動;重視做文明小公民的養成教育;堅持定時組織法紀、禁毒、安全教育。

堅持“以質量求生存”的理念，學校工作以教學為中心。全面執行國家教學計劃，狠抓教學常規管理;堅持“科研興校，科研強師”，立足校本教研，引進國家級課題“小學語文發展與創新教育”、省級英語課題“任務驅動式教學”，推進課程改革;開展豐富多彩的第二課堂活動，文化節、藝術節、科技節、體育節、讀書節、學科活動周、擂臺賽、背百首古詩、學會一種樂器等特色活動，提高了學生素質。

近幾年來，教育教學質量穩步提高。在龍崗區教育局組織的學業評價考試中，學校整體成績在街道中名列前茅;師生區級以上比賽獲獎323項，教師獲得各類榮譽稱號61人次，教師54篇論文在國家、省和市級刊物發表，24篇論文在區級以上獲獎;籃球隊、田徑隊、游泳隊、航模隊在市、區級比賽中屢屢獲獎;學校獲得中國教育學會“藝術教育先進單位”、小學語文教學法研究中心授予的“先進實驗學校標兵”，市委、市政府授予的“安全文明標兵小區”等集體榮譽20多項。